Porspoder dispose d'un site d'intérêt géologique du Finistère : l'anse de Poulsu. La partie maritime de la commune de Porspoder est concernée par la zone de transition de la réserve de biosphère des îles et de la mer d’Iroise. La commune de Porspoder est concernée par la présence de trois sites Natura 2000 : - Île d’Ouessant et Archipel de-Molène –  Île d’Ouessant et Archipel de-Molène . Le site « Île d’Ouessant et Archipel de-Molène », concerne la partie maritime du territoire communal de Porspoder. La commune possède deux visages, sa façade littorale et son arrière-pays plus rural. L'ensemble forme une mosaïque de milieux (zones humides, petits bois, ruisseaux, lavoirs, prairies, parcelles cultivées, dunes, estrans…) favorables à une biodiversité diversifiée